IDENTIFIKASI DAN KARAKTERISASI BAKTERI AMILOLITIK PADA UMBI Colocasia esculenta L. SECARA MORFOLOGI, BIOKIMIA, DAN MOLEKULER

Main Article Content

Destik Wulandari
Desi Purwaningsih

Abstract

Umbi talas (Colocasia esculenta L.) mempunyai kandungan pati tinggi yakni sebesar 77,9% sehingga dapat digunakan sebagai bahan untuk mengisolasi bakteri amilolitik. Tujuan penelitian ini adalah mengisolasi bakteri amilolitik dari umbi talas, dan kemudian mengidentifikasi serta mengkarakterisasi secara morfologi, biokimia dan molekuler menggunakan teknik 16S rRNA. Isolasi bakteri amilolitik dilakukan dengan cara menumbuhkan koloni bakteri pada media starch agar dan selanjutnya memilih koloni yang mempunyai zona bening. Bakteri yang menghasilkan zona bening kemudian dikarakterisasi dan diidentifikasi menggunakan metode pewarnaan Gram, pewarnaan spora, uji biokimia, dan uji molekuler 16S rRNA. Hasil menunjukkan terdapat tujuh isolat positif bakteri amilolitik yakni isolat ECE-1, ECE-2, ECE-3, ECE-4, ECE-5, ECE-6, dan ECE-7. Lima isolat diidentifikasi dengan teknik 16S rRNA. Hasil menunjukkan bahwa ketujuh isolat tersebut masing-masing secara berurutan diduga teridentifikasi sebagai Pseudomonas knackmussii, Bacillus siamensis, Bacillus siamensis, Bacillus subtilis, dan Bacillus altitudinis.

Article Details

How to Cite
Destik Wulandari, & Desi Purwaningsih. (2020). IDENTIFIKASI DAN KARAKTERISASI BAKTERI AMILOLITIK PADA UMBI Colocasia esculenta L. SECARA MORFOLOGI, BIOKIMIA, DAN MOLEKULER. Jurnal Bioteknologi Dan Biosains Indonesia, 6(2), 247–258. https://doi.org/10.29122/jbbi.v6i2.3084
Section
Articles

References

Agama-Acevedo E, Garcia-Suarez FJ, Gutierrez-Meraz F, Sanchez-Rivera MM, Martin ES, Bello-Perez LA (2011) Isolation and partical characterization of Mexican taro (Colocasia esculenta L) starch. Starch 63:139-146. doi: 10.1002/star.201000113

Armougom F, Raoult D (2009) Exploring microbial diversity using 16S rRNA high-throughput methods. J Comput Sci Syst Biol 2:074-092. doi: 10.4172/jcsb.1000019

Brooks GF, Carroll KC, Butel JS, Morse SA, Mietzner TA (2013) Mikrobiologi kedokteran Edisi 25. EGC, Jakarta

Chung A, Rainey F, Nobre MF, Burghardt J, da Costa MS (1997) Meiothermus Cerbereus sp. nov., a new slightly tthermophilic species with high levels of 3-hydroxy fatty acids. Int J Syst Bacteriol 47:1225–1230. doi: 10.1099/00207713-47-4-1225

Cole JR, Wang Q, Fish JA, Chai B, McGarrell DM, Sun Y, Brown CT, Porras-Alfaro A, Kuske CR, Tiedje JM (2013) Ribosomal database project: Data and tools for high throughput rRNA analysis. Nucleic Acids Res 42:D633-642. doi: 10.1093/nar/gkt1244

Hastuti US, Yakub P, Khasanah HN (2014) Biodiversity of indegenous amylolytic and cellulolytic bacteria in sago waste product at Susupu, North Moluccas. J Life Sci 8:920-924. doi: 10.17265/1934-7391/2014.11.010

Kusumawati DE (2014) Isolasi dan karakteristik senyawa antibakteri dari bakteri endofit tanaman miana (Coleus scutellariodes [L.] Benth.). Curr. Biochem. 1:45-50. doi: 10.29244/cb.1.1.45-50

Leonita S, Bintang M, Pasaribu FH (2015) Isolasi dan identifikasi bakteri endofit dari tumbuhan nyawai (Ficus variegata Blume) sebagai penghasil senyawa antibakteri. Curr Biochem 2:116–128. doi: 10.29244/cb.2.3.116-128

Mitidieri S, Martinelli AHS, Schrank A, Vainstein MH (2006) Enzymatic detergent formulation containing amylase from Aspergillus niger: A comparative study with commercial detergent formulations. Bioresour Technol 97:1217-1224. doi: 10.1016/j.biortech.2005.05.022

Nurmalinda A, Periadnadi, Nurmiati (2013) Isolasi dan karakterisasi parsial bakteri indigenous pemfermentasi dari buah durian (Durio zibethinus Murr.). J Bio UA 2:8-13. doi: 10.25077/jbioua.2.1.%25p.2013

Pangastuti A (2006) Definisi spesies prokaryota berdasarkan urutan basa gen penyandi 16S rRNA dan gen penyandi protein. Biodiversitas 7:292-296. doi: 10.13057/biodiv/d070319

Pawar HA, Choudhary PD, Kamat SR (2018) An overview of traditionally used herb, Colocasia esculenta, as a phytomedicine. Med Aromat Plants 7:1-7. doi: 10.4172/2167-0412.1000317

Pelczar MJ, Chan ECS (2005) Dasar-dasar mikrobiologi. UI Press, Jakarta

Reddy NS, Nimmagadda A, Rao KRSS (2003). An overview of the microbial α-amylase family. Afr J Biotehnol 2:645-648. doi: 10.5897/AJB2003.000-1119

Sardiani N, Litaay M, Budji RG, Priosambodo D, Syahribulan, Dwyana Z (2015) Potensi tunikata Rhopalaea sp. sebagai sumber inokulum bakteri endosimbion penghasil antibakteri; 1. Karakterisasi isolat. J Alam Lingkung 6

Stackebrandt E, Goebel BM (1995) A place for DNA-DNA reassociation and 16S rRNA sequence analysis in the present species definition in bacteriology. Int J Syst Bacteriol 44:846-849. doi: 10.1099/00207713-44-4-846

Setyati WA, Subagiyo S (2012) Isolasi dan seleksi bakteri penghasil enzim ekstraseluler (proteolitik, amilolitik, lipolitik dan selulolitik) yang berasal dari sedimen kawasan mangrove. Ilm Kelaut 17:164-168. doi: 10.14710/ik.ijms.17.3.164-169

Singh H, Saharan R, Sharma KP (2014) Isolation and characterization of amylase producing bacteria from diverse environmental samples. J Microbiol Biotechnol Res 4:8-18

Soeka Y S (2010) Optimasi dan karakterisasii a-amilase dari isolat aktinomisetes yang berasal dari Kalimantan Timur. Ber Biol 10:361–367. doi: 10.14203/beritabiologi.v10i3.751

Subhash C, Sarla S, Jaybarden (2012) Phytochemical screening of garhwal himalaya wild edible tuber Colocasia esculenta. Int Res J Pharm 3:181-186. doi: 10.7879/2230-8407

Tan R, Zou WX (2001) Endophytes: A rich source of functional metabolites. Nat Prod Rep 18:448-459. doi: 10.1039/ b100918o

Türker C, Özcan BD (2015) Isolation of alpha-amylase producing thermophilic bacillus strains and partial characterization of the enzymes. Turk J Agric-Food Sci Technol 3:387-393. doi: 10.24925/turjaf.v3i6.387-393.312

Utomo JS, Yulifianti R, Kasno A (2012) Kajian sifat fisikokimia dan amilografi pati garut dan ganyong. In: Prosiding seminar hasil penelitian tanaman aneka kacang dan umbi. Pusat Penelitian dan Pengembangan Tanaman Pangan, Malang, pp 673-680

Van der Maarel MJ, van der Veen B, Uitdehaag JC, Leemhuis H, Dijkhuizen L (2002) Properties and applications of starch-converting enzymes of the α-amylase family. J Biotechnol 94:137-155. doi: 10.1016/s0168-1656(01)00407-2

Vaseekaran S, Balakumar S, Arasaratnam V (2010) Isolation and identification of a bacterial strain producing thermostable a-Amylase. Trop Agric Res 22:1-11. doi: 10.4038/tar.v22i1.2603

Vijayalakshmi, Sushma K, Abha S, Chander P (2012) Isolation and characterization of Bacillus subtilis KC3 for amylolytic activity. Int J Biosci Bioinform 2:336-341. doi: 10.7763/IJBBB.2012.V2.128

Yarza P, Yilmaz P, Pruesse E, Glockner FO, Ludwig W, Schleifer KH, Whitman WB, Euzeby J, Amann R, Rossello-Mora R (2014) Uniting the classification of cultured and uncultured bacteria and archaea using 16S rRNA gene sequences. Nat Rev Microbiol 12:635-645. doi: 10.1038/nrmicro3330